复合土工膜在人工湿地、人工湖中主要起到防渗、保水的作用，单独的土工膜在以上环境中使用相对较少;而设计院多是以复合土工膜为防渗材料，这样设计的好处在于，单独的土工膜两侧有了土工布做为保护层，在施工过程中，就可以有效的避免了对土工膜的损坏，进而对整个工程的防渗效果也有了一个更好的保障。

但在铺设土工膜的过程中，气体会在膜下堆积而不能排出，尤其对于面积较大的人工湿地更是如此，由于微生物的分解，膜下的土壤会继续产生气体，当气体积聚到一定程度时，土工膜就会遭到破坏，从而降低人工湿地的防渗效果。人工湿地防渗材料成本高或施工难度大，且易造成二次污染，因此，土工膜作为一种新型的防渗材料，具有抗渗性好，抗拉能力强，能适应池体变形等优点，具有取代传统的粘土心墙和粘土斜墙等防渗体的趋势。

人造湿地的土工膜防渗层保护结构，包括铺设在人工湿地内的土工膜，人工湿地的底壁上设有基层，位于基层上的土工膜上设有若干贯穿土工膜的排气管，排气管通过土工膜远离基层的一端设有排气口，排气管的内壁固定设有固定盘，排气孔设在排气孔的一端，排气管内设有活动塞，活动塞与固定盘靠近排气口的端面相抵触，活动塞用于封闭排气孔，排气管内设有驱动活动塞抵紧固定盘的弹性件。